一、概念不同
预付款保函又称还款保函，是指银行根据申请人（合同中的预收款人，一般为出口商）的要求向受益人（合同中的预付款人，通常是进口商）开立的，保证一旦申请人未能履约，或未能全部履约，将在收到受益人提出的索赔后向其返还该预付款的书面保证承诺。
履约保函是指应劳务方和承包方（申请人）的请求，银行金融机构向工程的方（受益人）做出的一种履约保证承诺。
二、目的不同
履约保函主要是为了保证中标单位如约履行工程合同的内容；预付款保函是为了保证在甲方支付了预付款之后能收到合同约定的效果。
三、担保时间不同
履约保函的担保时间会贯穿整个项目，相对是比较长的；而预付款保函的担保时间一般在30-90天之间。
预付款保函办理依据
通常合同的条款中都会明确约定预付款保函比例及要求
签订合同前，中标人向招标人提供合同金额30%的预付款保函，设备及人员进场后招标人向中标人预付合同金额的30%，工程竣工验收合格支付至合同金额的70%，工程竣工结算完成付至工程结算金额的95%,余5%作为质保金质保期满无质量问题一次性无息付清。
常用的有预付款保函和质量保函的问题：
由于保函此种银行产品的特点为：见索即付，一旦发生赔付行为，公司在银行的信誉等级将受到严重影响，因此所有保函产品请慎重使用。
预付款保函自客户预付款到公司账户时生效，失效期由销售人员与客户约定，一般是在货物发出时保函失效。失效期较短也意味着公司承担的风险较小些。预付款保函可以延期但是强烈不建议延期。因为失效期较短也意味着公司承担的风险较小些。需要开具时，银行出纳在收到经审批的开函申请后，会告知经办人开函所需资料，经办人将开函所需资料提交银行出纳审核齐全后交付银行办理。
质量保函是风险较大的一种保函，后续一旦产品质量出现问题，将引起与质量保函相关的纠纷，对应保函中所担保的金额会被客户索赔。因此，原则上不建议开具此类保函，需要开具时，银行出纳在收到经审批的开函申请后，会告知经办人开函所需资料，经办人将开函所需资料提交银行出纳审核齐全后交付银行办理。
采用银行标准格式的保函，银行一般需要3-5个工作日可开出；非标格式保函由于银行需经银行内部的法务等风险控制部门审核后方可确定是否可开，因此开出时间会更长。
预付款保函指我行根据客户申请，向工程承包（承建）项目或物资采购方出具的、保证申请人在或采购方支付预付款后履行合同义务的书面担保文件。
产品功能
有利于客户及时收妥预付款资金，从而加快工程建设或备货等环节的。
产品特点
1.有效解决合同双方互不信任的问题。我行凭借自身良好的信誉，为承包方和采购方充当担保人，促进合同的顺利执行。
2.具备合同义务履行保证和合同价款支付保证作用。
3.工程承包（承建）方或供货方违约时，可通过执行预付款保函，对或买方进行经济补偿，并对违约方进行经济处罚，从而有效降低合同违约发生的可能性，避免为解决合同争议而诉诸仲裁或诉讼带来的成本。
收费标准
收费按照我行有关规定确定的收费原则和费率执行。
适用客户
1.工程承包项目中的承包方；
2.物资采购项目中的供货方；
3.船舶建造合同中的承建方。
申请条件
1.在我行开立公司账户；
2.具有经年检的法人营业执照或其他足以其经营合法性和经营范围的有效文件；
3.具有从事相应业务的资质（如对外承包资质、建筑企业等）；
4.在我行有授信额度、提供我行认可的足额有效反担保，或缴纳了足额保证金。
办理流程
1.保函申请
（1）申请人填写开立保函申请书；
（2）申请人提供保证金或其他反担保；
（3）申请人提交与业务背景相关的基础材料（如基础合同等）；
（4）申请人提交我行要求的其他开立保函必需的材料。
2.保函审核及开出
（1）我行对客户资信、资质、基础交易背景、相关申请材料进行审查；
（2）我行审核保函申请书及保函格式是否合法合规；
（3）我行对客户授信额度占用、保证金充足性或其他反担保情况进行审核落实；
（4）为客户开出保函。
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